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標(biāo)題: 大數(shù)據(jù)和云計(jì)算幫助實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療 [打印本頁]

作者: 寂靜天花板    時(shí)間: 2015-9-11 18:46
標(biāo)題: 大數(shù)據(jù)和云計(jì)算幫助實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療
今年3月我國成立了精準(zhǔn)醫(yī)療戰(zhàn)略專家組,國家衛(wèi)計(jì)委和科技部多次召開會(huì)議,論證啟動(dòng)精準(zhǔn)醫(yī)療計(jì)劃。一時(shí)間全國各地與精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)的機(jī)構(gòu)和協(xié)會(huì)如雨后春筍一般出現(xiàn),例如北京協(xié)和醫(yī)院、四川大學(xué)華西醫(yī)院等三甲醫(yī)院籌建的精準(zhǔn)醫(yī)療研究中心。各地與精準(zhǔn)醫(yī)療相關(guān)的論壇和項(xiàng)目也如火如荼的開展起來,例如在杭州舉辦的第四屆Bio4P國際高峰精準(zhǔn)醫(yī)療與智慧健康論壇,華西醫(yī)院開展的總數(shù)達(dá)一百萬人的全基因組測(cè)序,據(jù)悉中科院北京基因組研究所以及幾家大機(jī)構(gòu)已經(jīng)在啟動(dòng)類似的百萬人全基因組測(cè)序計(jì)劃。
  7月29日在央視《朝聞天下》的一個(gè)欄目里面,新聞?lì)l道針對(duì)“聚焦精準(zhǔn)醫(yī)療”主題對(duì)精準(zhǔn)醫(yī)療做了一個(gè)老百姓通俗易懂的介紹。簡(jiǎn)單來說,精準(zhǔn)醫(yī)療就是利用現(xiàn)代化的醫(yī)學(xué)手段為患者制定個(gè)性化的預(yù)防和治療方案。節(jié)目全面回應(yīng)了這一在2015上半年引爆科學(xué)界和醫(yī)藥圈的概念。然而故事還沒有結(jié)束,媒體報(bào)道里面每天充斥著各種醫(yī)療概念和技術(shù):分子學(xué)診斷、基因檢測(cè)、靶向藥物、個(gè)性化用藥。。。但是,這些都是“醫(yī)療”,“精準(zhǔn)”去了哪里呢?實(shí)現(xiàn)“精準(zhǔn)”的大數(shù)據(jù)和云計(jì)算應(yīng)該在哪里體現(xiàn)呢?

  精準(zhǔn)醫(yī)療的核心在于精準(zhǔn),而不是醫(yī)療

  醫(yī)療本身有其發(fā)展的規(guī)律和方式。這里精準(zhǔn)的實(shí)現(xiàn),需要醫(yī)療大數(shù)據(jù)的實(shí)現(xiàn),而實(shí)現(xiàn)醫(yī)療大數(shù)據(jù)的前提,需要云計(jì)算的助力。然而我們必須清楚的一點(diǎn),云計(jì)算無法解決醫(yī)療問題,只能是快速準(zhǔn)確發(fā)現(xiàn)問題的存在。云解決方案既無法解決醫(yī)療問題,也無法發(fā)現(xiàn)醫(yī)療背后的大數(shù)據(jù)問題,能夠發(fā)現(xiàn)問題的,在于生物信息學(xué)。是否生物信息學(xué)需要云計(jì)算才能解決臨床問題,這里需要打上一個(gè)很大的問號(hào)。

  云解決方案能夠助力生物信息提供解決方案,但不是一個(gè)必需品。好比我們需要解決的是吃飽問題的時(shí)候,花太多的時(shí)間在研究用綠色還是紅色的碗子盛飯,用深盤子還是淺盤子來盛菜,這些都是無法解決痛點(diǎn)的無用功。現(xiàn)在中國云計(jì)算的現(xiàn)狀就是這樣,一方面云計(jì)算在各個(gè)行業(yè)還沒有做到足夠深的整合和足夠廣的覆蓋度,另一方面在傳統(tǒng)醫(yī)療領(lǐng)域還沒有達(dá)到足夠完善的信息化。

  信息化不等于大數(shù)據(jù)英特爾公司生命科學(xué)全球總經(jīng)理Ketan Paranjape曾經(jīng)在接受記者采訪時(shí)提到過大而復(fù)雜的基因數(shù)據(jù)在采集、傳輸、存儲(chǔ)、分析等方面,帶來了對(duì)計(jì)算的要求、對(duì)存儲(chǔ)的要求、對(duì)網(wǎng)絡(luò)的要求,包括高性能計(jì)算。從大數(shù)據(jù)的采集層面來看,這里需要國家的投入。在中國基因行業(yè)的發(fā)展中,這方面投入的最多的當(dāng)之無愧是華大基因了。其中最值得耐人尋味的是,數(shù)據(jù)采集本應(yīng)該是國家投入的基礎(chǔ)科學(xué)研究,在中國卻成為了讓企業(yè)來承擔(dān)的一項(xiàng)工程。毫無疑問,通過企業(yè)燒錢來完成數(shù)據(jù)采集這一步,這種模式是無法復(fù)制和模仿的。用華大基因首席科學(xué)家李英睿先生的話來說:“華大基因一方面是做基礎(chǔ)的科學(xué)研究,另一方面是把基礎(chǔ)科學(xué)的研究成果轉(zhuǎn)化為公眾可以使用的真實(shí)產(chǎn)品。我們主要通過整合各種平臺(tái)和技術(shù)手段給公眾提供相應(yīng)的臨床服務(wù)!睋Q一句話來說就是,華大基因從上游到下游,從B端到C端,從產(chǎn)學(xué)研閉環(huán)來說,已經(jīng)全部能夠通吃通做。

  既然華大基因能夠通過通吃來完成數(shù)據(jù)采集,我們不得不提出一個(gè)問題:大數(shù)據(jù)的本質(zhì)是什么?大數(shù)據(jù)的形成一定不是由壟斷的巨頭來完成。大數(shù)據(jù)的4V特點(diǎn)是大量 (Volume)、高速 (Velocity)、多樣 (Variety)、價(jià)值 (Value)。這里的數(shù)據(jù)有一個(gè)產(chǎn)生的過程,產(chǎn)生的過程能夠進(jìn)行采集。很多的互聯(lián)網(wǎng)巨頭通過控制數(shù)據(jù)的入口來達(dá)到大數(shù)據(jù)的采集,比如谷歌和百度。在產(chǎn)業(yè)界,各企業(yè)對(duì)數(shù)據(jù)入口的爭(zhēng)奪一直都沒有停止過。入口能夠隨著科技的發(fā)展和人們生活方式的改變而發(fā)生遷移,比如從微博到微信,從網(wǎng)頁端到移動(dòng)端。對(duì)入口的控制通?梢酝ㄟ^控制設(shè)備實(shí)現(xiàn),也可以通過平臺(tái)實(shí)現(xiàn)。比如蘋果手機(jī)和小米手機(jī)就是通過設(shè)備來實(shí)現(xiàn)控制數(shù)據(jù)的入口,微信平臺(tái)就是通過控制平臺(tái)實(shí)現(xiàn)了數(shù)據(jù)流量的入口控制。

  設(shè)備和平臺(tái)在基因行業(yè),最終能夠?qū)崿F(xiàn)入口為王的兩個(gè)方式:設(shè)備和平臺(tái)。采集數(shù)據(jù)需要設(shè)備,分析數(shù)據(jù)需要平臺(tái)。這里的設(shè)備只有實(shí)現(xiàn)互聯(lián)網(wǎng)化的智能設(shè)備,才能勝任大數(shù)據(jù)時(shí)代通過控制設(shè)備達(dá)到控制入口的目的。比如Illumina的測(cè)序儀,如果只是一臺(tái)生產(chǎn)基因數(shù)據(jù)的儀器,Illumina是無法成為未來基因行業(yè)巨頭的。只有讓每一臺(tái)設(shè)備接入Illumina的在線追蹤系統(tǒng),Illumina的系統(tǒng)能夠追蹤每一個(gè)上機(jī)的樣本信息,一旦設(shè)備接入互聯(lián)網(wǎng),所有的樣本信息和數(shù)據(jù)信息能夠自動(dòng)同步到設(shè)備控制的數(shù)據(jù)中心進(jìn)行采集。每一臺(tái)設(shè)備不僅能夠傳輸設(shè)備的狀態(tài)監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)、樣本信息,還能夠傳輸每臺(tái)設(shè)備的使用情況和地理位置。這些數(shù)據(jù)的采集便是通過設(shè)備來控制數(shù)據(jù)的入口。另一個(gè)數(shù)據(jù)的入口便是數(shù)據(jù)分析平臺(tái),這里通過對(duì)數(shù)據(jù)的處理和分析實(shí)現(xiàn)對(duì)入口的控制。儀器設(shè)備廠商能否也做這一塊呢,答案是可以的,不過代價(jià)非常的高。其中一個(gè)關(guān)鍵的原因在于基因數(shù)據(jù)分析的個(gè)性化和碎片化。要解決這個(gè)原因的答案就是平臺(tái),這里的平臺(tái)不是云平臺(tái)。很多的人分不清基因大數(shù)據(jù)平臺(tái)和基因大數(shù)據(jù)云平臺(tái)這兩者的區(qū)別,其實(shí)能夠類比的例子就是阿里巴巴平臺(tái)和阿里巴巴云平臺(tái)。

  云平臺(tái)只是實(shí)現(xiàn)平臺(tái)的一個(gè)技術(shù)載體,真正的核心不是在于云計(jì)算本身,而是在于對(duì)平臺(tái)的運(yùn)營和模式的實(shí)現(xiàn)。所以很多人對(duì)于奇云諾德的理解就是基因大數(shù)據(jù)云平臺(tái),而忘記這里準(zhǔn)確的定義是基因大數(shù)據(jù)平臺(tái),云平臺(tái)只是實(shí)現(xiàn)在線的一個(gè)技術(shù)模塊。如果說滴滴打車的核心在于托管滴滴打車平臺(tái)的云平臺(tái),顯然這是很錯(cuò)誤的理解。

  只有明白了這一點(diǎn),我們?cè)賮砜丛朴?jì)算對(duì)于精準(zhǔn)醫(yī)療的助力,只能是實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)的計(jì)算載體。從云計(jì)算對(duì)于數(shù)據(jù)采集的入口來看,這里更大的貢獻(xiàn)其實(shí)是解決了數(shù)據(jù)的碎片化。通過互聯(lián)網(wǎng)的在線平臺(tái)把碎片化的資源整合起來實(shí)現(xiàn)大數(shù)據(jù)采集。

  從這樣的趨勢(shì)來看,云計(jì)算的發(fā)展是去中心化一個(gè)過程,最終像華大基因這樣的巨頭控制的數(shù)據(jù)采集方式會(huì)被云計(jì)算的推廣所弱化。以云計(jì)算為核心的基因大數(shù)據(jù)平臺(tái)會(huì)迅速的發(fā)展起來。這是實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)醫(yī)療的第一個(gè)階段,數(shù)據(jù)的云端化。云計(jì)算助力精準(zhǔn)醫(yī)療的第二個(gè)階段,實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的安全性管理。

  沒有一家企業(yè)能夠保證數(shù)據(jù)的安全性。商業(yè)界的規(guī)律永遠(yuǎn)是用戶為王。用戶對(duì)于數(shù)據(jù)安全和個(gè)人隱私的意識(shí)是與生具有的人性,用戶的對(duì)數(shù)據(jù)安全的敏感度取決于維護(hù)的代價(jià)和門檻有多高;驍(shù)據(jù)的安全性從數(shù)據(jù)產(chǎn)生開始就存在,具體在哪個(gè)環(huán)節(jié)得到用戶的重視,取決于基因產(chǎn)業(yè)的成熟程度。云計(jì)算在數(shù)據(jù)安全性問題解決方案上面已經(jīng)相對(duì)成熟,具體到基因數(shù)據(jù)是否適用,我相信這是一個(gè)技術(shù)問題而不是一個(gè)道德問題。但是有一點(diǎn)能夠肯定的是,基因數(shù)據(jù)的安全性維護(hù)必定托管于第三方屬性很強(qiáng)的平臺(tái),而不會(huì)是華大基因這樣的數(shù)據(jù)生產(chǎn)供應(yīng)商。因?yàn)橐脩艚邮懿门泻瓦\(yùn)動(dòng)員都是同一個(gè)人是很難理解的,除非這個(gè)行業(yè)非常的小眾和封閉。

作者: leftwall    時(shí)間: 2015-9-11 20:14
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